يستخدم نيوميسين كعلاج موضعي لالتهابات الجلد البكتيرية السطحية مثل الخدوش والجروح البسيطة والحروق الطفيفة، التي تنتج عن بكتيريا المكورات العنقودية والمكورات العقدية، يستخدم
نيوميسين كمضاد حيوي لعلاج أو الوقاية من العدوى البكتيرية التي تسببها أنواع معينة من البكتيريا، يستعمل في حالات العدوى الجلدية والجروح السطحية، الوقاية من الالتهابات قبل الإجراءات الجراحية، تقليل البكتيريا المعوية قبل العمليات الجراحية الهضمية، في بعض الحالات يستخدم كجزء من العلاج لأمراض معوية معينة.